კავშირის ხელმძღვანელი ორგანოებია:
ა) წევრთა საერთო კრება;
ბ) გამგეობა;
გ) სკოლის გაძღოლის კონფერენცია;
დ) საგარანტიო საბჭო.
გამგეობა - შედგება კავშირის 7 წევრისაგან. გამგეობაში შედიან როგორც გაძღოლის კონფერენციის წარმომადგენლები, ასევე, კავშირის სხვა წევრები. ამასთან, გაძღოლის კონფერენცია გამგეობაში თავისი წრიდან წარადგენს 3 წევრს, ხოლო დანარჩენი 4 წევრი არჩეულ უნდა იქნას საერთო კრების მიერ იმ პირობით, რომ ისინი არ უნდა იყვნენ მასწავლებელთა კოლეგიის და გაძღოლის კონფერენციის წევრები; გამგეობა იკრიბება თვეში ერთხელ. საჭიროების შემთხვევაში გამგეობას შეუძლია ჩაატაროს დამატებითი სხდომები.
გამგეობა თავისი რიგებიდან ირჩევს თავმჯდომარეს და თავმჯდომარის მოადგი¬ლეს. გამგეობის თავმჯდომარე არ უნდა იყოს გამგეოაბაში სკოლის გაძღოლის მიერ წარდგენილი წევრი.
გაძღოლის კონფერენცია - წარმართავს სკოლის პედაგოგიურ მუშაობას და პასუხისმგებელია მასზე. გაძღოლის კონფერენციასთან ზეპირი შეთანხმებით ან მისი წერილობითი თანხმობით ამ წესდების შესაბამისად წყდება სხვა საკითხები;გაძღოლის კონფერენციის გადაწყვეტილებები სასურველია ერთხმად იქნას მიღებული. თუ ერთსულოვნება ვერ მიიღწევა, გადაწყვეტილებები მიიღება უბრალო უმრავლესობით.
საქმეთა მმართველი - ნიშნავს გამგეობა გაძღოლის კონფერენციასთან ზეპირი ან წერილობითი შეთანხმებით. საქმეთა მმართველი უნდა იყოს კავშირის წევრი.
